理性分子設計,提高Ideonella sakaiensis菌PET降解酶的熱穩(wěn)定性
01
文章背景簡介
BACKGROUND INTRODUCTION
聚對苯二甲酸乙二酯(PET) 由于其耐久性、價格低廉和使用方便等優(yōu)點,是工業(yè)中應用最廣泛的合成塑料之一。然而,廢棄的塑料廢物是造成環(huán)境問題的主要原因之一,會污染海洋和土壤中的環(huán)境,并且這些塑料經(jīng)過風化分解后會產(chǎn)生小于 5 mm 的微塑料顆粒,這些細小顆粒會對環(huán)境問題造成更大的影響。而且,這些微塑料被海洋生物攝入后會在它們的體內(nèi)積累,最終通過食物鏈轉(zhuǎn)移到人類的體內(nèi)。因此,塑料廢棄物不僅是造成環(huán)境污染的主要因素之一,而且對人類健康有著嚴重影響。為了解決或減輕這些環(huán)境問題,人們開發(fā)了一些對塑料廢物進行化學和物理處理的技術(shù);然而,這些技術(shù)帶來的副產(chǎn)品也依然會對環(huán)境污染有一定的影響。因此,研究者試圖開發(fā)使用角質(zhì)酶和脂肪酶的生物方法來降解塑料;然而,這些酶對 PET 降解能力較低,并且需要相對較高的溫度(約 70℃)才能實現(xiàn)其酶的活性。
最近,科學家發(fā)現(xiàn)了一種全新的微生物細菌,將可以解決塑料帶來的環(huán)境問題,這種細菌名叫Ideonella sakaiensis,能夠有效的利用PET作為碳源,并且可以利用兩種酶(PETase 和 MHETase)將PET聚合物降解成對苯二甲酸單羥乙基的單體(MHET)。更重要的是,和來源于其它細菌的PET降解酶相比,來源于Ideonella sakaiensis的IsPET降解酶不僅具有比迄今為止已知能夠降解 PET 的任何其他酶高得多的降解活性,而且還在中等溫度下發(fā)揮作用,對環(huán)境具有很好的適用性。
2019年3月11日,韓國慶北大學生命科學院的Hyeoncheol Francis Son等人在《ACS Catalysis》雜志(IF=12.221,化學一區(qū))發(fā)表了題目為“Rational Protein Engineering of Thermo-Stable PETase from Ideonella sakaiensis for Highly Efficient PET Degradation”的文章。
02
所用到的主要方法
METHODS
1.蛋白質(zhì)制備
2.熔化溫度(Tm)測量
3.PET薄膜降解
4.蛋白質(zhì)熱滅活實驗
5.HPLC分析
6.結(jié)晶、數(shù)據(jù)收集和結(jié)構(gòu)確定
7.PET薄膜結(jié)晶度的測量
03
文章主要內(nèi)容摘要
ABSTRACT
聚對苯二甲酸乙二酯(PET)的廣泛使用引起了各種環(huán)境和健康問題,使用生物酶法降解PET塑料是一個很有前途的解決方案。盡管來自Ideonalla sakaiensis的PET降解酶 (IsPETase) 是迄今為止在溫和條件下PET 降解活性最高 的PET 降解酶,但其熱穩(wěn)定性較低限制了其應用。為了提高 PET 降解活性,本文根據(jù)IsPETase的蛋白結(jié)構(gòu)信息,利用IsPET降解酶的突變體進行了熱穩(wěn)定性篩選,開發(fā)了一種合理的蛋白質(zhì)工程策略。設計了具有穩(wěn)定的β6-β7 連接區(qū)域和擴展的亞位點IIc的IsPETaseS121E/D186H/R280A 突變體。與IsPET降解酶的野生型相比,IsPETaseS121E/D186H/R280A突變體 的Tm 值提高了8.81℃,PET的降解活性增強了14倍。通過突變體的結(jié)構(gòu)測定也進一步驗證了設計的蛋白改造技術(shù)是有效的,并且通過熱滅活實驗進一步證實了其具有高的熱穩(wěn)定性。
本文所提出的蛋白改造技術(shù)和開發(fā)的突變體為實現(xiàn)在溫和條件下能夠?qū)?PET 完全生物降解提供了一個新思路。
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