《Nature》子刊收錄宣武醫(yī)院頭頸CTA重建研究結(jié)果
近日,《Nature 》子刊《Nature Communication》在線刊發(fā)了題為《Rapid vessel segmentation and reconstruction of head and neck CTA using 3D convolutional neural network》的科研論文(IF=12.121)。該論文由首都醫(yī)科大學(xué)宣武醫(yī)院盧潔教授團(tuán)隊(duì)與數(shù)坤(北京)網(wǎng)絡(luò)科技有限公司共同研究發(fā)布。論文第一作者為傅璠博士、通訊作者為盧潔教授。
該研究首次利用3D卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)設(shè)計(jì)了一個(gè)可實(shí)現(xiàn)頭頸CTA血管分割的后處理系統(tǒng),能夠自動(dòng)除去骨影像,自動(dòng)完成頭頸CTA血管重建。通過這樣的途徑,該模型一定程度上重塑了頭頸CTA臨床路徑。
通常而言,頭頸CTA檢查需要患者進(jìn)行兩次CT掃描,但在該模型的輔助之下,只需一次增強(qiáng)掃描,患者便能獲得可用于重建的影像結(jié)果。同時(shí),在長(zhǎng)達(dá)兩年的研究周期中,AI重建的精度與準(zhǔn)確度也隨著訓(xùn)練的推進(jìn)而不斷趨近于完美,逐漸能與資深醫(yī)師相當(dāng)。
作為發(fā)病率高、死亡率高、復(fù)發(fā)率高、醫(yī)療負(fù)擔(dān)高的全球性疾病,卒中等腦血管病患者達(dá)萬億級(jí)別。 對(duì)頭頸CTA臨床路徑進(jìn)行創(chuàng)新性突破,及其背后的臨床價(jià)值是該研究成果被《Nature》子刊收錄的重要原因之一。
此外,該論文的研究過程也重現(xiàn)了人工智能成長(zhǎng)——練就一個(gè)有效的模型并非一蹴而就,這是一個(gè)循序漸進(jìn)的過程。
全球億級(jí)患者量的臨床需求
最新全球疾病負(fù)擔(dān)研究(Global Burden of Disease Study,GBD)顯示,我國(guó)總體卒中終生發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)為39.9% ,位居全球首位,這意味著中國(guó)人一生中每5個(gè)人約有2個(gè)人會(huì)罹患卒中。此外,卒中也是我國(guó)疾病所致壽命損失年的第一位病因!2019中國(guó)衛(wèi)生健康統(tǒng)計(jì)提要》數(shù)據(jù)顯示,2018年我國(guó)居民因腦血管病致死比例超過20%,這意味著每5位死亡者中至少有1人死于卒中。
全球而言,2019年3月11日,《Lancet Neurology》雜志發(fā)布的相關(guān)數(shù)據(jù),2016年,僅卒中患病人數(shù)就為8010萬,是全球第二大死亡原因。
缺血性卒中以及多種腦血管疾病診療中,頭頸CTA檢查是常規(guī)檢查手段。然而,日益增加的檢查量與有限CTA醫(yī)師之間的矛盾,使得醫(yī)院對(duì)于患者的需求應(yīng)接不暇。科室工作壓力逐漸增大,患者也許等待較長(zhǎng)時(shí)間才能完成CTA檢查預(yù)約及報(bào)告獲取。
基于卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的深度學(xué)習(xí)算法或能解決這一矛盾,自人工智能的洪流席卷醫(yī)療領(lǐng)域以來,許多醫(yī)療科技企業(yè)、醫(yī)院學(xué)者紛紛嘗試用AI的方式重塑CTA檢查流程。提高CTA 檢查效率、提高診斷準(zhǔn)確率,其可能帶來億萬患者的獲益——這正是盧潔教授團(tuán)隊(duì)選擇頭頸CTA作為研究對(duì)象的重要因素之一,亦是全球醫(yī)療發(fā)展向善的趨勢(shì)。
量變到質(zhì)變,AI優(yōu)化臨床路徑
經(jīng)過多年發(fā)展,人工智能介入冠脈CTA的能力已經(jīng)在實(shí)踐之中得到驗(yàn)證,大量三甲醫(yī)院心內(nèi)科已經(jīng)上線了數(shù)坤科技等AI企業(yè)研發(fā)的“AI+CTA”產(chǎn)品。但相比于冠脈CTA,頭頸CTA的重建過程顯得更為復(fù)雜,其中的難度提升來源于CT影像之中骨顯像帶來的干擾。
“由于拍攝頭頸CT時(shí)無法忽略顱骨部分,而顱骨密度高,在CT圖像上會(huì)以與造影劑類似的高亮方式呈現(xiàn),掃描的數(shù)值也非常接近。因此,醫(yī)生必須使用一些特殊的方法將血管與顱骨區(qū)分出來!睌(shù)坤科技臨床研究院負(fù)責(zé)人郭寧解釋到。
具體而言,為消除顱骨顯像對(duì)于重建的影響,醫(yī)生往往會(huì)要求患者進(jìn)行兩次CT掃描,第一次不注射造影劑,第二次注射造影劑。在第一次CT掃描之中,能夠顯像的只有擁有高密度的顱骨部分,而第二次顯像則能同時(shí)包含顱骨與血管。在進(jìn)行兩次掃描之后,對(duì)其結(jié)果進(jìn)行一個(gè)減法,減去兩次影像中均為高亮顯示的顱骨部分,剩下的便是重建需要的血管影像。
實(shí)際之中,這樣的操作常常會(huì)遇到很多問題。首先,這種方式對(duì)于患者的配合度要求非常高,患者兩次掃描的位置必須匹配,也不能移動(dòng),否則減影效果會(huì)有所欠缺。其次,兩次CT檢查無疑會(huì)給予患者更多的輻射攝入,雖然劑量仍然在安全范圍之內(nèi),但容易引起患者的擔(dān)憂。
AI介入后,頭頸CTA的檢查流程由此發(fā)生了較大的改變。將減少一次CT掃描,為患者帶來更好的就醫(yī)體驗(yàn),而重建影像耗費(fèi)的時(shí)間也將由此大幅降低。
超十億次血管勾畫驗(yàn)證,AI實(shí)現(xiàn)顱內(nèi)細(xì)小血管精準(zhǔn)分割
回到論文,整個(gè)實(shí)驗(yàn)大致可分為模型訓(xùn)練與模型驗(yàn)證兩個(gè)部分。18259例頭頸CTA數(shù)據(jù)集均采集于2017年6月至2018年11月間,由5家國(guó)內(nèi)頂尖三甲醫(yī)院協(xié)作提供。按照每個(gè)病例600幅影像,每張影像10根血管進(jìn)行計(jì)算,整個(gè)實(shí)驗(yàn)過程已對(duì)超過10億根血管進(jìn)行了AI勾畫與分割。
為保證樣本數(shù)據(jù)的有效性,研究人員手動(dòng)檢查排除了507項(xiàng)圖像質(zhì)量較差的樣本數(shù)據(jù),剩下9370例男性數(shù)據(jù)與8889例女性數(shù)據(jù),所有參與者年齡均位于63±12歲這一區(qū)間。
研究設(shè)計(jì)
完成樣本構(gòu)建后,研究人員使用數(shù)坤科技開發(fā)的CerebralDoc AI模型對(duì)影像進(jìn)行后處理重建。
一般的深度神經(jīng)網(wǎng)絡(luò),在精度要求非常高的醫(yī)療圖像中完成高標(biāo)準(zhǔn)的分割,難度比較大。比如,血管這種一張片子中只占幾十甚至幾個(gè)像素,在數(shù)坤之前,國(guó)內(nèi)外都沒有更好的網(wǎng)絡(luò)能夠大規(guī)模應(yīng)用于臨床。
數(shù)坤的CerebralDoc模型充分考慮了CT影像的三維特性和人體的組織器官特征,將待學(xué)習(xí)的組織目標(biāo)(比如血管)的各類特征進(jìn)行放大,在訓(xùn)練時(shí)能夠充分將所需的特點(diǎn)進(jìn)行學(xué)習(xí)提取。數(shù)坤專門設(shè)計(jì)的訓(xùn)練過程,能做到訓(xùn)練時(shí)從整體和局部分別觀察血管,不斷增強(qiáng)網(wǎng)絡(luò)的魯棒性,這是很獨(dú)特的。
相比較數(shù)坤自己研發(fā)的前幾代網(wǎng)絡(luò),新的神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)在對(duì)顱內(nèi)細(xì)小血管的追蹤以及排除骨、靜脈等干擾上又有突破。
數(shù)坤科技研究院負(fù)責(zé)人郭寧告訴動(dòng)脈網(wǎng):“這個(gè)實(shí)驗(yàn)進(jìn)行至今已經(jīng)超過2年。模型最初建立的時(shí)候,像一個(gè)剛剛出生的孩子,隨著網(wǎng)絡(luò)的快速成長(zhǎng),影像重建的準(zhǔn)確率、效率,逐漸提升,到了論文發(fā)布時(shí),AI的重建準(zhǔn)確率已經(jīng)趨近于1!
效率質(zhì)量不斷提升,醫(yī)生+AI 優(yōu)勢(shì)互補(bǔ)
論文發(fā)布時(shí),該AI的算法評(píng)價(jià)指標(biāo)戴斯相關(guān)系數(shù)、血管加權(quán)分?jǐn)?shù)和召回率均達(dá)到90%以上。
具體而言,AI 在獨(dú)立測(cè)試集重建準(zhǔn)確率達(dá)到了93.1%。而與152例手動(dòng)重建數(shù)據(jù)進(jìn)行對(duì)比,AI重建的合格率達(dá)到92.1%,此外,AI 重建VR圖像的血管邊界比手動(dòng)重建更光滑、最大密度投影重建(MIP)圖像的去骨效果更佳。
a右腦中動(dòng)脈閉塞,沒有建立側(cè)支循環(huán); b基底動(dòng)脈瘤伴血栓和鈣化,可在CerebralDoc重建的MIP中觀察到; c寰枕手術(shù)后,AI中的金屬偽影得到了更好的抑制; d直接由主動(dòng)脈引起的右頸總動(dòng)脈和左椎動(dòng)脈的分叉嚴(yán)重狹窄
AI重建和手動(dòng)重建圖像質(zhì)量的比較。第一列可見AI 重建圖像血管管壁更加光滑,分支顯示更遠(yuǎn);第二列可見手動(dòng)去骨受掃描的影響較大
在效率提升上,AI同樣發(fā)揮出優(yōu)異的表現(xiàn)。該系統(tǒng)應(yīng)用于宣武醫(yī)院后,該院影像平均后處理時(shí)間由14.22±3.64min減至4.94±0.36min,時(shí)間縮短到原來的1/3。同時(shí),技師的點(diǎn)擊操作次數(shù)也因?yàn)锳I的介入而飛速下降,由115.87±25.9下減至4下。
此外,使用5個(gè)月之后,宣武醫(yī)院進(jìn)行CTA后處理技師已經(jīng)從3人縮減至1人。郭寧表示:“技師人數(shù)的變化反應(yīng)了AI能力的成長(zhǎng),在實(shí)驗(yàn)之初,AI處理的結(jié)果仍需要醫(yī)生進(jìn)行修補(bǔ)確認(rèn),但隨著模型逐漸成熟,醫(yī)生已經(jīng)能夠?qū)⒋蟛糠止ぷ鹘唤oAI進(jìn)行,轉(zhuǎn)而投身更有意義的分析與研究工作之中。這個(gè)時(shí)候,AI技術(shù)已經(jīng)與醫(yī)生的工作深入的融合在了一起!
無遠(yuǎn)弗屆
長(zhǎng)期以來,我們一直無法通過定量的方式衡量AI為醫(yī)生帶來的價(jià)值,而本篇論文的研究方法無疑提供了一條合理的路徑。
實(shí)驗(yàn)已經(jīng)有效驗(yàn)證了AI在頭頸CTA影像后處理中的優(yōu)效性,研究團(tuán)隊(duì)仍在持續(xù)尋求提升空間。
郭寧告訴動(dòng)脈網(wǎng):“ 本次實(shí)驗(yàn)排除了一些存在偽影,或者存在先天血管畸變的病例,這將是我們下一階段研究的重點(diǎn)目標(biāo)!
這放在整個(gè)人工智能領(lǐng)域同樣適用。AI 經(jīng)過了多年的發(fā)展,應(yīng)用范圍和應(yīng)用深度上需醫(yī)生和科學(xué)家團(tuán)隊(duì)不斷向深度探索,接下來,我們還需要更多這樣產(chǎn)學(xué)結(jié)合的成果,用實(shí)際結(jié)果證實(shí)AI的優(yōu)效性。
作者:趙泓維
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